第二季紧接第一季结尾。幸存的科学家们被军方扣押并审问，他们对深海中的“智慧流体”信息闭口不谈。与此同时，全球各大洋同时报告有巨型不明物体浮出水面，不是UFO，而是类似深海城市的“气泡泡”。新一季引入了一组来自中国的深海救援队，与美方合作探索这些气泡。他们发现，海底智慧生物并非要侵略，而是在逃离某种更古老的、正在吞噬海洋的黑暗物质。这一次，人类必须学会和“怪物”合作，才能拯救地球。
全面升级了第一季的格局，从密室逃生变成了全球性的灾难悬疑。特效明显增加了预算，深海世界的奇观令人叹为观止。在科幻外衣下，依然保持了对于人性贪婪的批判。新加入的角色非常讨喜，多线叙事并行不乱，挖坑也挖得让人心甘情愿。
警探张大勇和记者高婕一边破案一边恋爱，每集一个离奇命案。
在终日不见太阳的极夜里，一个失去儿子的母亲，和一个被父母抛弃的少年，在荒野木屋中互相取暖。
女孩梅根与网友见面后失踪，她的朋友在网上寻找真相，却一步步走进陷阱。
一间百年酒店汇聚了豪门千金、野心家与卧底，上演欲望与救赎的夜宴。
核战后，地球上最后一只独角兽的角被挖走做成了机甲核心，它自己穿上机甲找回了角。
一只聪明的小白鼠被投放进一个为老鼠设计的完美“乐园”，它很快发现，天堂的规则就是培养出最好的实验品。
一个被献祭的孩子化作南瓜头怪物，每年万圣节回来屠杀邪教徒的后代。
为阻止德军攻占斯大林格勒，一支由囚犯组成的坦克连，必须完成“自杀式”东进任务。